原天津市第四十三中学始建于1954年，1958年改制为完中校，1978年被定为区属重点校，1990年被市教育局确定为首批高中校。1995年晋升为区属市级重点中学。2007年7月，经天津市政府和国家教育部调整，原南开大学附属中学整建制合并入原天津市第四十三中学并更名为南开大学附属中学。

新校址坐落于天津市南开区三潭路，校园内宁静幽雅的校园，是学校良好的育人环境；南开学子蓬勃的朝气、立志成才的志向和惜时如金的求学精神，是学生最好的榜样；浓郁的学术气氛，是对学生的最好熏陶。附中在南开大学独特的人文地理环境中形成了自己的办学特色，四十五年培养了大批优秀人才，在社会上享有很高的声誉。南开大学附属中学和始建于清末的天津市南开中学是两所不同的中学。

（新）南开大学附属中学位于天津市南开区三潭路165号，毗邻南开大学、天津大学。占地面积8万多平方米，总建筑面积6.4万平方米，有 10 座主体建筑，现有75个教学班，3400余名学生。